1973年以來，他在中國科學(xué)院生物物理所與合作者經(jīng)過二十年長期艱苦攻關(guān)，發(fā)表論文110篇。寫成專著《針灸經(jīng)絡(luò)生物物理學(xué)-中國第一大發(fā)明的科學(xué)驗(yàn)證》（北京出版社，1989）。他們運(yùn)用電子學(xué)、生物化學(xué)、生物物理、聲學(xué)和形態(tài)及動植物等多種學(xué)科檢測和獨(dú)特的實(shí)驗(yàn)法，準(zhǔn)確地揭示人體經(jīng)絡(luò)線的分布位置，證實(shí)了古典經(jīng)絡(luò)圖譜的高度科學(xué)性和客觀存在。以后又提出“經(jīng)絡(luò)是多層次、多功能、多形態(tài)立體結(jié)構(gòu)的調(diào)控系統(tǒng)”的理論。這一研究成果運(yùn)用于臨床之中，取得神奇效果。因此獲得國家科委首屆“星火杯”創(chuàng)造發(fā)明特等獎。此外還10次榮獲國家衛(wèi)生部、市科委等科學(xué)進(jìn)步獎。

　　祝總驤現(xiàn)在是中國科學(xué)院生物物理所主任教授、中國管理科學(xué)院終身教授，并被美國國際針灸醫(yī)學(xué)院聘為教授。他先后幾十次出國訪問，10次被授予榮譽(yù)勛章、會員、科學(xué)博士、教授、顧問等稱號。

 　　祝教授根據(jù)經(jīng)絡(luò)學(xué)說提出了“312經(jīng)絡(luò)百歲健身法”，現(xiàn)已被國家體育總局推薦為科學(xué)健身法。國內(nèi)外已有上千萬人應(yīng)用這一方法進(jìn)行自我醫(yī)療保健，取得優(yōu)異效果。

　　2008年11月，首屆“中華原創(chuàng)醫(yī)學(xué)復(fù)興論壇”在京召開，論壇的主題是“重鑄中華醫(yī)魂”。祝總驤先生作為演講嘉賓參加了本論壇，演講題目是《312經(jīng)絡(luò)鍛煉法與人類健康》。 

　　主要事跡

      ★中國科學(xué)院生物物理研究所終身教授
 　  ★首次科學(xué)實(shí)驗(yàn)證明人體經(jīng)絡(luò)存在的世界級經(jīng)絡(luò)學(xué)家
　　★北京炎黃經(jīng)絡(luò)研究中心主任
　　★被美國、英國、法國等十余國授予勛章、院士、博士、教授、顧問等稱號
 　  ★國家首屆“星火杯”創(chuàng)造發(fā)明特等獎獲得者
 　  ★其首創(chuàng)的“312”經(jīng)絡(luò)鍛煉法全球受益人群超過3000萬人，遍及數(shù)十個(gè)國家
　　★“312”經(jīng)絡(luò)鍛煉法被國家體育總局推薦為科學(xué)健身法
　　★歐盟連續(xù)11年派遣代表團(tuán)來華學(xué)習(xí)“312”經(jīng)絡(luò)鍛煉法
　　★中央電視臺、中央人民廣播電臺、《人民日報(bào)》、《世界日報(bào)》等海內(nèi)外權(quán)威媒體持續(xù)關(guān)注近20載。